Früher zählten die Mitglieder des Imkervereins Bad Säckingen zum Bezirk Waldshut. Am 18.09.1892 wurde auf einer Imkerversammlung des Bezirksvereins Waldshut die Bildung des Imkervereins beschlossen. Die förmliche Gründung des Vereins fand am 9.10.1892, damals unter dem Name „Hauensteiner Bienenzuchtverein“ statt.
Nach einiger Weiterentwicklungen und Namensänderungen von Landesverband Badischer Imker (1895) über Kreisfachgruppe Imker, Säckingen (1933) wurde der Verein 1948 in den Imkerverein Säckingen umbenannt.
Im Sommer 1942 wurde in Günnenbach ein Wanderstand eingerichtet. 1949 wurde der Lehrbienenstand von Günnenbach nach Waldkirch verlegt. 1952 konnte in Obersäckingen der Lehrbienenstand, gemeinsam mit der landwirtschaftlichen Schule, eingeweiht werden.
46 Imker traten dem Verein 1892 bei, 1893 stieg diese Zahl auf 134. Über die Jahre schwankten die Mitgliederzahlen stark zwischen 300 und 35. 2024 liegt sie aktuell bei 46 Mitgliedern. Auch die geflügelten Mitgliederzahlen schwankten über die Jahre: 1906 betreute der Imkerverein insgesamt 2259 Bienenvölker, im Jahr 2024 bei 251 Völker.